Le laboratoire LCG est organisé en cinq départements scientifiques et quatre plateformes technologiques. Le personnel et les compétences scientifiques sont gérés par les départements, tandis que les plateformes regroupent les moyens techniques et numériques. Il faut souligner que l’accès aux plateformes est gratuit à tout chercheur du laboratoire, ainsi qu’à chaque autre équipe de recherche ou de formation de l’Ecole des Mines.

Le Conseil du Laboratoire est celui des laboratoires CNRS en activité, impliqués dans la création de LCG (PECM et LTDS).